1995年被卫生部、联合国儿童基金会、世界卫生组织授予“爱婴医院”；2001年成为北京市首批医保定点单位；2003年被市政府指定为该市唯一收治社会救助精神病患者的定点医院；2009年成为新型农村合作医疗定点医院和北京市“120”急救站；2011年被指定为北京市危重孕产妇转、会诊定点医院。
医院目前下设内科（呼吸内科、心内科、脑病科、内分泌科、监护室、肝脾胃病科、血液透析中心）、外科（肛肠科、泌尿外科、普外科）、创伤骨科、妇（产）科、中医儿科特色诊疗中心、针灸科、骨伤科、皮肤科、眼科、耳鼻喉科、感染性疾病科、急诊科、麻醉科、口腔科、治未病科、康复科、国医馆、精神科等共计40个临床科室，药剂科、放射科、检验科、功能科、病理科、血库、消毒供应室、病案室、营养科等9个医技科室。大型医疗设备齐全，拥有1.5T核磁共振、64排螺旋CT、DR、彩超、关节镜、腹腔镜、宫腔镜、检验科全自动生化分析仪流水线等大型医疗设备，拥有现代化的层流手术室7间，具备开展各种手术的条件。
医院骨伤科是国家中医药管理局“十二五”重点建设专科，北京市中医骨伤学科团队建设基地，北京市职工创新工作室，“3+3薪火传承”董福慧名老中医工作室，全国中医学术流派华山正骨流派和天池流派二级工作站。多年来，逐步形成了以中医特色整脊技术为主、结合现代微创治疗方法，治疗项痹病、腰痛病、膝痹病、拇外翻等急慢性、骨关节病疑难症的特色技术。脑病科是北京市中医管理局“十二五”重点建设专科，工作中开展了急性缺血性脑卒中静脉溶栓治疗和24小时动态录像脑电监测诊疗方法。擅长运用巨刺疗法治疗中风偏瘫病、放血疗法治疗面瘫病、平衡罐治疗眩晕病。儿科是北京市中医儿科特色诊疗中心，运用中西医结合疗法治疗小儿哮喘、反复呼吸道感染、顽固性咳嗽、厌食、小儿惊厥、遗尿、抽动症等儿科常见病及多发病。眼科是北京市中医管理局“十二五”重点建设专科，北京医院眼科技术协作单位，在多年的临床实践中形成了具有中西医结合特色的诊疗方法，可开展超声乳化白内障吸除术、玻璃体切割术、青光眼滤过术、激光小梁成形术、糖尿病全视网膜光凝术、泪道狭窄插管术、翼状胬肉切除术、结膜瓣移植术等高精尖眼科技术。精神病合并躯体病科也是北京市中医管理局“十二五”重点建设专科，精神病合并传染病科是国内首家中西医结合治疗精神病合并传染病的科室，拥有实力雄厚的医疗专家团队，填补了国内精神病人合并躯体病、传染病治疗的空白。
医院以学科建设为着力点，加强特色专科建设。树立了以中西医结合方法诊治骨伤、脑病、眼科、儿科、精神病合并躯体病、精神病合并传染病为特色的专科优势。目前为国家中医药管理局预防保健科（精神卫生组）全国协作组组长单位；国家中医药管理局“十二五”重点专科协作组成员单位（精神科）；国家中医药管理局“十二五”重点专科建设单位（骨伤科）； 北京市中医管理局“十二五”重点建设专科眼科、脑病科、精神病合并躯体病科、精神病合并传染病科； “北京市京北国医馆”；“北京市中医儿科特色诊疗中心”；北京市中医药基层学科团队建设单位（骨伤科）；设有19个专题门诊，以多个学科和中心的建设带动医院各专业学科的发展。
医院将秉承“研岐黄之术，行济世之功”的办院宗旨，以“精诚仁和、传承创新”的医院文化精神，以提高医疗技术水平和服务质量需求为主体，以骨伤、眼科、脑病、精神合并躯体病、精神合并传染病、儿科为医院发展的重点学科，中西并重、突出中医特色，大专科、大综合协同发展，打造成一所现代化的三级甲等中西医结合医院。