2016年，中山六院通过三级甲等医院等级评审，现已发展成为一所技术水平一流、国内知名的具有显著专科特色的“三甲”综合医院，胃肠肛门专科、生殖医学等学科已形成全国影响力，是广东省的一张特色医疗名片，全省乃至全国的疑难病症患者慕名而来。
如今的中山六院是一所集医疗、教学、科研、预防和康复保健等为一体的三级甲等综合性医院，为中山大学十家直属附属医院之一，拥有3个院区（员村院本部金融城院区、瘦狗岭北院区和柯木塱智慧城院区），有华颖社区、员村街等2个社区卫生服务中心（站）。编制病床1202张，实际开放病床1323张。医院是广州市社会医疗保险定点医疗机构分级管理最高级别的“AAA级医院”之一，是广州市医疗保险定点医院、广东省省内异地就医联网结算医院、国家跨省异地就医联网结算医院、公费医疗定点医院（广东省、广州市、各区）。
截至2020年4月，全院在岗职工2321人，卫生专业技术人员1955人。全院高级职称162人，博士生导师57人，硕士生导师144人，包括中山大学“百人计划”领军人才、国务院特殊津贴专家、卫生部有突出贡献中青年专家、广东特支计划“南粤百杰”等一大批临床、科研、教学等专业技术人才。医院系中山大学培养高层次医学人才的临床教学基地，承担着本科生、八年长学制学生、硕士、博士研究生的教学任务。
首任院长、荣誉院长汪建平教授，曾任中华医学会外科学分会结直肠肛门外科学组组长11年、《中华胃肠外科杂志》主编、《外科学》五年制本科教材第八版、第九版主编，卫生部《结直肠癌诊疗规范》（2010年版）制订专家组组长。第二任院长兰平教授，卫生部有突出贡献的中青年专家，国家重点研发计划首席科学家，现任中国医院协会副会长、广东省医师协会副会长。现任院长文卫平教授，现任中华医学会耳鼻咽喉头颈外科专业委员会副主任委员，中国医师协会耳鼻咽喉科分会副会长，广东省医学会耳鼻咽喉头颈外科专业委员会主任委员，广东省抗癌协会头颈肿瘤专业委员会主任委员，广东省医学领军人才。
医院院本部（金融城院区）座落在广州市中央商务区核心地带，毗邻天河区政府、天河公园、珠江新城，与琶洲会展中心隔江相望。紧靠科韵路、华南快速干线，临近黄埔大道和花城大道、临江大道，距地铁五号线-员村站仅80米，交通十分便利。
中山六院人实践着孙中山先生“博学、审问、慎思、明辨、笃行”的精神，恪行“守·真”院训，鞭策着自己以崭新的精神风貌，以更高超的医术、优质的服务，努力把中山六院建设成为专科特色鲜明的现代化大型综合性医院，国内前列、国际知名的研究型医院、胃肠疾病国际临床与科研中心，竭诚为患者提供温馨、优质、高效的医疗保健服务。，

国内一流的胃肠肛门专科
  中山六院胃肠肛门专科（胃肠肛门外科、消化内科、肿瘤内科、胃肠病学研究所），拥有博士导师34人，硕士导师72人，高级职称者50余人。设置专科床位800张，拥有国内最高水平之一的结直肠肿瘤、胃肿瘤会诊诊治中心，开设华南地区首家结直肠肿瘤MDT门诊、炎症性肠病MDT门诊、胃肿瘤MDT门诊和便秘门诊。
根据疾病特点细分胃肠肛门学科群，仅结直肠肛门外科就下设结直肠癌、炎症性肠病、疝气、放射性肠炎、慢性便秘、肛周良性疾病等十个亚专科，分科最细，专业诊治，专业护理，专业服务。技术团队能解决食管、胃、小肠、结直肠、肛门等外科领域的重大、复杂和疑难病例。直肠癌保肛术、保护性功能居全国领先水平，食管、胃、小肠、结肠等疑难复杂恶性肿瘤综合治疗效果显著，肛门良性疾病、盆底功能性疾病中西医结合治疗国内一流。
仅2019年，我院胃肠专科共收治结直肠癌患者28225例（含放化疗），胃癌患者3915例（含化疗），炎症性肠病患者4830例，痔疮2617例、肛瘘（以复杂性肛瘘为主）2646例，疝气1038例，在胃肠道疾病诊治方面取得突出成绩。配备的中山六院消化内镜科占地达1500平方米，是全国最优秀的内窥镜中心之一，拥有全套先进的消化道专科设备，开展的无痛胃肠镜受到了广大患者的热烈欢迎。
作为专家组组长单位，协助国家卫生部完成了《结直肠癌诊疗规范（2010、2015年版）》、是中华医学会结直肠肛门外科学组组长单位，国家统编教材《外科学（第8、9版）》主编单位，《内科学（第七版）》副主编单位,为推动我国胃肠外科的规范化诊治做出了重要贡献。此外，还协助国家卫计委等部门完成了炎症性肠病、疝、痔、瘘、肛裂等治疗规范和指南。
 
综合学科百花齐放
学科齐全、实力雄厚。医院按正科级建制设18个处室（下设行政管理科室44个），专业科室61个，教学机构10个，科研机构4个，15个专业管理委员会。医院各临床科室设置齐全，其中普通外科为国家重点学科、卫生部临床重点专科，结直肠肛门外科、肾内科、麻醉科、医学影像科等为广东省临床重点专科。2017年，我院普通外科、胃肠外科、肛肠外科、生殖医学、消化内科、新生儿科、康复医学科等7个专科上榜广东省首份“医院最强科室榜单”。

自挂牌以来，从海内外引进各学科学术带头人40多人，开设包括预防保健科、内科、外科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、肿瘤科、急诊医学科、康复医学科、麻醉科、重症医学科、病理科、医学影像科、中医科等25个临床一级科目和52个临床二级科目。医院设天河区员村街社区卫生服务中心及华颖社区卫生服务站，致力于为员村街14个居委会5万5千本地居民及4万余流动人口提供常见病诊疗与预防接种、慢性病管理、传染病防控、健康教育等公共卫生服务，以全科医生为主导的方便、优质、价廉、连续的社区卫生服务。
 
多中心共同协作
生殖医学中心集国内优秀的生殖医学及妇科内分泌技术，采用国际水平的医疗设备，成功完成全国首例、世界第十例的卵巢组织移植手术，在硬件实力、治疗技术的成功率和稳定性、解决疑难病能力方面已经处于领先，并独创了先进的医疗服务方式，努力为广大不孕不育患者提供优质的专科诊治。2016年顺利通过了ISO9001：2008认证，是华南地区第一家通过此认证的辅助生殖技术机构。
血液透析室、腹膜透析室、现拥有世界血液透析机一流品牌透析机60台和两台CRRT机，保证透析治疗可靠,腹膜透析患者生活质量、维持时间保持国内领先地位。临床听力室与美国等多个国家听力中心建立了密切联系，被授予丹麦国际听力公司在中国国内的临床听力检测示范基地。影像检验中心引进目前国际上顶尖的检查设备，提供集健康咨询、检查、诊断、教育、管理等一体化的预防保健服务。此外，医院还设置有盆底治疗专科、血液透析室、腹膜透析室、睡眠呼吸障碍诊疗专科、新生儿科、临床营养科、生物治疗专科等一系列诊疗平台，
配备全自动发药系统、层流净化手术间等，还拥有医用直线加速器（LA）、心血管成型系统（DSA）PET-CT、ECT、640层动态容积能谱CT、彩色B超、全自动生化检测仪、骨密度检测仪等大型检查设备。医院不断引进新知识、新技术、新设备，极大地促进了医疗水平的提高。
 
科学教研成绩斐然国际交流卓越
中山大学胃肠病学研究所/广东省胃肠病学研究所（广东省公益一类事业单位）依托于中山大学附属第六医院，同时也是“广东省结直肠盆底疾病研究重点实验室”，下设中心实验室、分子诊断实验室、数据库、组织库及生物治疗中心、实验动物中心，总面积约5520 m2。研究所实行课题负责人（PI）制度，现有研究人员45人，其中教授14人，副教授16人，年立项科研经费在2000万元以上。围绕国家重大疾病防治政策、方针，结合广东省切实需求，开展结直肠盆底疾病的创新研究，产生了一批发表在Cancer Cell，Gastroenterology、Gut等国际著名期刊上的高水平科研成果，为制定我国在肠道病领域的诊治指南提供理论依据和实验平台。
近几年科研成绩斐然，汪建平教授带领的团队，用将近20年时间潜心研究，其研究成果《基于肛门功能和性功能保护的直肠癌治疗关键技术创新与推广应用》项目获2016年度国家科学技术进步二等奖，该项目的推广将令数十万患者受益。“直肠癌保功能手术提高患者生存质量的系列研究”、“结直肠炎症与肿瘤的基础与临床系列研究”与“结直肠癌防治关键技术创新与推广应用”等三项研究分别荣获2007年度、2011年度、2018年度广东省科技进步一等奖。
中山六院期刊中心下辖3本期刊——Gastroenterology Report、《中华胃肠外科杂志》和《中华炎性肠病杂志》。其中Gastroenterology Report2018年SCI影响因子2.194；《中华胃肠外科杂志》2014－2016连续3年入选“百种中国杰出学术期刊”，2017年获得中国精品科技期刊、广东省精品科技期刊称号；《中华炎性肠病杂志》2017年正式创刊，填补了我国该领域学术期刊的空白，学术影响力与日俱增，为学术交流搭建良好平台
医院积极开展多渠道国内外的交流与合作，与国外多个著名的医疗机构建立了长期友好的双边交流和合作关系，邀请国内外知名专家教授定期来院讲学，保证了诊疗技术、科学研究和学术活动与国际先进水平同步。
医院系中山大学培养高层次医学人才的临床教学基地，为国内首批普通外科专科医师规范化培训基地，承担着本科生、八年长学制学生、博士、硕士研究生、住培医师等教学任务，多次在广东省、广州市以及大学的临床技能比赛中斩获殊荣。同时医院积极开展多渠道国内外的交流与合作，与国外多个著名的胃肠疾病中心建立了长期友好的双边交流和合作关系，邀请国内外知名专家教授定期来院讲学，保证了诊疗技术、科学研究和学术活动与国际先进水平同步。