医院有茶亭院区、滨海院区、奥体院区、闽南医院，总编制床位4500张，形成“一院多区、一体多翼、协同发展”的办医格局。 

医院学科齐全，实力雄厚。设有临床科室53个，医技科室10个。神经内科、神经外科、整形外科、骨科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔外科、高血压科、皮肤科、康复科、重症医学科、结直肠外科、病理科、检验科、核医学科等，是医院优势学科，并设有一批中心化学科群（如神经医学、骨与手外科学、感染病学、创伤医学、颌面医学等等）和一批特色专病中心（如肿瘤精准免疫治疗中心、睡眠医学中心、变态（过敏）反应诊疗中心、难治疗性高血压介入诊疗中心、护理治疗中心等等）。拥有5个国家临床重点专科、3个福建省高水平临床医学中心、1个福建省高水平实验平台、11个福建省临床重点专科、2个福建省医学重点专科、2个领先医疗特色专业、5个优先发展学科、4个省级重点实验室、9个福建省临床医学研究中心、9个省级研究所（院）；20个省医学会专科分会、12个省医师协会专科分会、12个省级质控中心和10个福建医大研究所、5个福建医大临床医学重点学科挂靠医院。医院承担国家级刊物——《中华高血压杂志》《中华细胞与干细胞杂志（电子版）》《中国骨与关节损伤杂志》的编辑和出版工作。现有I期药物临床研究中心和23个药物临床试验专业，并设有院士专家工作站（2019年获评“福建省示范院士工作站”荣誉称号），获批设立国家级博士后科研工作站。

医院于2000年成立福建医科大学第一临床医学院。拥有临床医学培训中心，是美国心脏协会（AHA）授权的心血管急救培训中心，是全国大学生校外实践教学基地，配备无线智能模拟人等一系列先进的教学模具，拥有骨科、神经科、耳鼻喉头颈外科、普通外科、泌尿外科和妇科等6个国家内镜与微创医师定期考核培训基地。有32个专业获批国家级住院医师规范化培训基地；神经外科学、呼吸与危重症医学、内科危重症医学、外科危重症医学及普通外科学等5个专业获批国家级专科医师规范化培训基地。全科医学科、内科、口腔全科、康复医学科4个专业基地获批国家“住院医师规范化培训重点专业基地”，全科医学专业基地获得全国优秀全科专业住培基地荣誉称号。学院目前拥有博士学位授予权一级学科6个,博士专业学位授予权学科2个；硕士学位授予权一级学科9个，硕士专业学位授予权学科9个；有博士研究生导师80名、硕士研究生导师 261名。近五年拥有省级教学成果奖2项，省级一流课程8个，省级教育科研项目12个，省级教学团队3个，获首届省级高校教师创新大赛副高组一等奖。学院多次组队代表福建医科大学参加全国高等医学院校大学生临床技能竞赛，屡获佳绩，其中2016年以全国第一名佳绩荣获特等奖。制作的《临床医学技能操作教程》，由人民卫生电子音像出版社出版，纳入“十三五”国家重点音像出版规划品种。学院与近10个国家以及港台地区建立了协作关系并开展广泛的学术交流。

医院以国家医改政策为引领，积极探索医联体长效共建发展机制和分级诊疗体系与机制，与泉州市泉港区人民政府组建省内首家府院共建的融合型医联体，探索紧密型医联体合作模式及以重点项目带动学科建设的医疗健康联合体模式，以优势学科带动、跨区域牵头组建专科、专病联盟，实现了优质医疗资源下延、技术下沉，形成具有“附一”特色的医疗健康联合体。

八十五载风雨洗礼，附一医院始终坚持以人民健康为中心，发挥大型公立医院在“医改”中的示范和带头作用，所采取的系列改革措施和创新的管理机制成为全国卫生系统关注的亮点，连续两次蝉联全国“医院改革创新奖”，被授予福建省首批“互联网医院”，并先后多次荣获全国管理、服务创新类奖项，成为福建省医院管理的标杆。在“医改”和应对疫情大考中，交出附一的高质量答卷，获评“全省卫生健康系统先进集体”、“福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体”、“福建省先进基层党组织”、“福建省五一劳动奖状”、“第十四届文明单位”、“母婴友好医院”，为广大人民群众提供坚实的健康保障。

（以上数据截止时间为2021年12月31日）